Markery permanentne wyróżniają się przede wszystkich niezmywalnym, wodoodpornym tuszem. Używamy ich często w pracy, w biurze i w domu, kiedy chcemy pozostawić trwały napis. Markery niezmywalne nadają się idealnie do oznaczania płyt CD. Większość markerów permanentnych posiada specjalny tusz i grube końcówki piszące (okrągłe lub ścięte). Można nimi pisać i rysować na różnych powierzchniach, w tym także nietypowych, m.in. na szkle, plastiku, ceramice czy też drewnie. Tusz w dobrym markerze permanentnym powinien być odporny na działanie promieni słonecznych, nie blaknąć i być pozbawiony szkodliwych dla środowiska substancji, m.in. ksylenu i toulenu.